Además de las extrañas circunstancias en que aparecieron los hermanos Guevara en el estado Carabobo, se generaron dudas sobre las circunstancias en que murieron dos de los presuntos autores materiales del atentado.

En los alrededores de Plaza Venezuela, poco antes del mediodía del 23 de noviembre, el abogado Antonio López Castillo (32 años) habría disparado contra funcionarios del Cicpc cuando su vehículo-un Toyota aparentemente sin identificación policial- se cruzó frente al auto del sospechoso.

Como resultado del enfrentamiento fallecieron el litigante y el inspector Alberto Pavón (26 años), adscrito a la División contra Drogas.

El abogado Marco Antonio Rodríguez llamó la atención sobre un impacto de bala debajo de la barbilla, pues a su juicio el disparo debió hacerse a una distancia de 30 cm a 60 cm, lo que indicaría un ajusticiamiento. El cuerpo de López tenía al menos quince impactos de bala.

Además, los representantes legales de la familia López Castillo aseguraron que horas antes de su muerte, López habría dejado grabado en correo de voz que había sido detenido por funcionarios policiales.

En el automóvil de López Castillo se habría hallado una agenda personal con la que los investigadores localizaron los datos de otros presuntos implicados. Además, habrían encontrado dos granadas, una pistola 9 milímetros y un cheque emitido por el empresario Isaac Pérez Recao, a quien se investiga por el caso de los atentados a sedes diplomáticas de España y Colombia.

Otro suceso fatal ocurrió dos días después en el hotel El Edén, del estado Lara, en un presunto enfrentamiento en el que funcionarios policiales dieron muerte a Juan Carlos Sánchez.
Los padres del joven fallecido aseguran que recibieron una llamada en la mañana de los cuerpos de seguridad informándoles que su hijo estaba detenido, pero en la tarde les dijeron que había fallecido en un enfrentamiento con la policía.

Un hecho adicional se suma a las dudas razonables: Algunos testigos aseguran que la noche del 18 de noviembre vieron a dos motos y una patrulla de la Disip en la zona de la explosión. Los funcionarios habrían observado la explosión desde lejos, pero en lugar de acercarse aceleraron la marcha.